Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms