Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou4f1P17208 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou4f1P17208 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou4f1P17208 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou4f1P17208 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou4f1P17208 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou4f1P17208 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pou4f1P17208 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pou4f1P17208 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pou4f1P17208 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pou4f1P17208 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pou4f1P17208 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms