Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Gm21976J3QNN2 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Gm21976J3QNN2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Gm21976J3QNN2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm21976J3QNN2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm21976J3QNN2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm21976J3QNN2 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm21976J3QNN2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21976J3QNN2 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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