Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F8A0AVK6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms