Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms