Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CltbQ6IRU5 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms