Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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PTPRSQ13332 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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