Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms