Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERCC6Q03468 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms