Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms