Protein–RNA interactions for Protein: O89012

Magea8, MCG115467, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Magea8O89012 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Magea8O89012 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Magea8O89012 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Magea8O89012 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Magea8O89012 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Magea8O89012 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Magea8O89012 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Magea8O89012 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Magea8O89012 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Magea8O89012 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms