Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms