Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Trappc6aQ78XR0 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Trappc6aQ78XR0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6aQ78XR0 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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