Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms