Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms