Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms