Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
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