Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
POLEQ07864 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
POLEQ07864 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
POLEQ07864 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
POLEQ07864 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
POLEQ07864 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
POLEQ07864 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
POLEQ07864 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
POLEQ07864 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
POLEQ07864 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
POLEQ07864 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
POLEQ07864 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
POLEQ07864 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
POLEQ07864 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
POLEQ07864 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
POLEQ07864 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
POLEQ07864 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
POLEQ07864 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
POLEQ07864 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
POLEQ07864 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
POLEQ07864 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
POLEQ07864 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
POLEQ07864 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
POLEQ07864 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
POLEQ07864 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
POLEQ07864 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLEQ07864 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLEQ07864 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLEQ07864 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLEQ07864 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLEQ07864 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLEQ07864 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLEQ07864 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLEQ07864 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLEQ07864 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
POLEQ07864 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLEQ07864 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
POLEQ07864 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLEQ07864 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLEQ07864 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLEQ07864 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLEQ07864 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLEQ07864 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLEQ07864 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLEQ07864 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLEQ07864 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLEQ07864 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLEQ07864 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLEQ07864 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLEQ07864 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLEQ07864 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLEQ07864 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLEQ07864 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLEQ07864 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
POLEQ07864 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLEQ07864 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLEQ07864 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLEQ07864 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLEQ07864 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLEQ07864 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLEQ07864 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLEQ07864 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLEQ07864 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLEQ07864 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLEQ07864 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLEQ07864 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLEQ07864 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLEQ07864 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLEQ07864 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLEQ07864 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLEQ07864 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLEQ07864 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLEQ07864 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLEQ07864 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLEQ07864 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLEQ07864 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLEQ07864 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLEQ07864 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLEQ07864 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLEQ07864 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLEQ07864 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLEQ07864 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLEQ07864 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLEQ07864 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLEQ07864 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLEQ07864 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLEQ07864 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLEQ07864 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLEQ07864 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLEQ07864 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLEQ07864 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLEQ07864 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLEQ07864 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLEQ07864 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLEQ07864 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLEQ07864 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
POLEQ07864 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLEQ07864 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
POLEQ07864 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLEQ07864 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms