Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVFC1P60507 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms