Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOP2AP11388 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms