Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Casq1O09165 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casq1O09165 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casq1O09165 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casq1O09165 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms