Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Gm28038F7BCN9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Gm28038F7BCN9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Gm28038F7BCN9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Gm28038F7BCN9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Gm28038F7BCN9 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Gm28038F7BCN9 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Gm28038F7BCN9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Gm28038F7BCN9 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm28038F7BCN9 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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