Protein–RNA interactions for Protein: F6ZR08

Gm15056, Predicted gene 15056, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm15056F6ZR08 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm15056F6ZR08 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm15056F6ZR08 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm15056F6ZR08 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm15056F6ZR08 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm15056F6ZR08 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm15056F6ZR08 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm15056F6ZR08 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm15056F6ZR08 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm15056F6ZR08 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm15056F6ZR08 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm15056F6ZR08 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm15056F6ZR08 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm15056F6ZR08 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm15056F6ZR08 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm15056F6ZR08 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm15056F6ZR08 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm15056F6ZR08 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm15056F6ZR08 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm15056F6ZR08 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm15056F6ZR08 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm15056F6ZR08 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm15056F6ZR08 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm15056F6ZR08 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm15056F6ZR08 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm15056F6ZR08 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm15056F6ZR08 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm15056F6ZR08 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm15056F6ZR08 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm15056F6ZR08 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm15056F6ZR08 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm15056F6ZR08 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm15056F6ZR08 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm15056F6ZR08 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm15056F6ZR08 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm15056F6ZR08 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm15056F6ZR08 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm15056F6ZR08 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm15056F6ZR08 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm15056F6ZR08 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms