Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms