Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms