Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Znf628Q8CJ78 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Znf628Q8CJ78 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Znf628Q8CJ78 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Znf628Q8CJ78 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Znf628Q8CJ78 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Znf628Q8CJ78 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Znf628Q8CJ78 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Znf628Q8CJ78 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Znf628Q8CJ78 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Znf628Q8CJ78 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Znf628Q8CJ78 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf628Q8CJ78 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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