Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Treml4Q3LRV9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms