Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms