Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GLI3P10071 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GLI3P10071 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GLI3P10071 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GLI3P10071 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GLI3P10071 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GLI3P10071 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GLI3P10071 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GLI3P10071 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GLI3P10071 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GLI3P10071 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GLI3P10071 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GLI3P10071 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GLI3P10071 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GLI3P10071 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GLI3P10071 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GLI3P10071 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GLI3P10071 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GLI3P10071 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GLI3P10071 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GLI3P10071 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GLI3P10071 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GLI3P10071 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GLI3P10071 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GLI3P10071 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GLI3P10071 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GLI3P10071 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GLI3P10071 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GLI3P10071 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GLI3P10071 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GLI3P10071 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GLI3P10071 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GLI3P10071 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GLI3P10071 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GLI3P10071 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GLI3P10071 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GLI3P10071 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GLI3P10071 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GLI3P10071 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GLI3P10071 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GLI3P10071 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GLI3P10071 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GLI3P10071 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GLI3P10071 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GLI3P10071 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GLI3P10071 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GLI3P10071 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GLI3P10071 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GLI3P10071 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GLI3P10071 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GLI3P10071 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GLI3P10071 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GLI3P10071 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GLI3P10071 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GLI3P10071 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GLI3P10071 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GLI3P10071 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GLI3P10071 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GLI3P10071 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GLI3P10071 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GLI3P10071 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GLI3P10071 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GLI3P10071 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GLI3P10071 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GLI3P10071 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GLI3P10071 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GLI3P10071 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GLI3P10071 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GLI3P10071 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GLI3P10071 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GLI3P10071 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GLI3P10071 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GLI3P10071 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GLI3P10071 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GLI3P10071 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GLI3P10071 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GLI3P10071 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GLI3P10071 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GLI3P10071 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GLI3P10071 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GLI3P10071 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GLI3P10071 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GLI3P10071 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GLI3P10071 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GLI3P10071 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GLI3P10071 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GLI3P10071 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GLI3P10071 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GLI3P10071 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GLI3P10071 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GLI3P10071 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GLI3P10071 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GLI3P10071 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GLI3P10071 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GLI3P10071 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GLI3P10071 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GLI3P10071 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GLI3P10071 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GLI3P10071 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GLI3P10071 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms