Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms