Protein–RNA interactions for Protein: Q61626

Grik5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik5Q61626 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik5Q61626 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms