Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms