Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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