Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx3P81067 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx3P81067 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx3P81067 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx3P81067 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx3P81067 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx3P81067 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms