Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms