Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms