Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms