Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms