Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms