Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XIRP1Q702N8 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XIRP1Q702N8 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XIRP1Q702N8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XIRP1Q702N8 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XIRP1Q702N8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XIRP1Q702N8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XIRP1Q702N8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
XIRP1Q702N8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
XIRP1Q702N8 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
XIRP1Q702N8 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
XIRP1Q702N8 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
XIRP1Q702N8 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
XIRP1Q702N8 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
XIRP1Q702N8 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
XIRP1Q702N8 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
XIRP1Q702N8 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
XIRP1Q702N8 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
XIRP1Q702N8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
XIRP1Q702N8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
XIRP1Q702N8 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XIRP1Q702N8 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms