Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms