Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms