Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms