Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC28A2O43868 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms