Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC7A4O43246 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC7A4O43246 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC7A4O43246 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC7A4O43246 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC7A4O43246 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC7A4O43246 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC7A4O43246 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC7A4O43246 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC7A4O43246 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC7A4O43246 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC7A4O43246 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC7A4O43246 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC7A4O43246 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC7A4O43246 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC7A4O43246 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC7A4O43246 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC7A4O43246 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC7A4O43246 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC7A4O43246 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC7A4O43246 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC7A4O43246 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC7A4O43246 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC7A4O43246 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC7A4O43246 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC7A4O43246 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC7A4O43246 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC7A4O43246 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC7A4O43246 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC7A4O43246 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC7A4O43246 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC7A4O43246 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms