Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms