Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms