Protein–RNA interactions for Protein: S4R185

Gm26938, Predicted gene, 26938 (Fragment), mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26938S4R185 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm26938S4R185 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm26938S4R185 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm26938S4R185 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm26938S4R185 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm26938S4R185 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm26938S4R185 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm26938S4R185 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm26938S4R185 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm26938S4R185 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm26938S4R185 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm26938S4R185 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm26938S4R185 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm26938S4R185 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm26938S4R185 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm26938S4R185 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm26938S4R185 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm26938S4R185 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm26938S4R185 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm26938S4R185 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm26938S4R185 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm26938S4R185 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm26938S4R185 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm26938S4R185 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm26938S4R185 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm26938S4R185 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm26938S4R185 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm26938S4R185 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm26938S4R185 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm26938S4R185 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm26938S4R185 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm26938S4R185 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm26938S4R185 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm26938S4R185 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm26938S4R185 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm26938S4R185 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm26938S4R185 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm26938S4R185 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm26938S4R185 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm26938S4R185 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm26938S4R185 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm26938S4R185 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm26938S4R185 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm26938S4R185 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm26938S4R185 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm26938S4R185 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm26938S4R185 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm26938S4R185 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm26938S4R185 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm26938S4R185 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm26938S4R185 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm26938S4R185 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm26938S4R185 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm26938S4R185 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm26938S4R185 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm26938S4R185 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm26938S4R185 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm26938S4R185 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm26938S4R185 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm26938S4R185 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm26938S4R185 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm26938S4R185 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm26938S4R185 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm26938S4R185 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm26938S4R185 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm26938S4R185 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm26938S4R185 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm26938S4R185 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm26938S4R185 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm26938S4R185 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm26938S4R185 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm26938S4R185 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm26938S4R185 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm26938S4R185 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm26938S4R185 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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