Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna2d3Q9Z1L5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacna2d3Q9Z1L5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna2d3Q9Z1L5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna2d3Q9Z1L5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna2d3Q9Z1L5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms