Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Skp2Q9Z0Z3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Skp2Q9Z0Z3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Skp2Q9Z0Z3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Skp2Q9Z0Z3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Skp2Q9Z0Z3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Skp2Q9Z0Z3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Skp2Q9Z0Z3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Skp2Q9Z0Z3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Skp2Q9Z0Z3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Skp2Q9Z0Z3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Skp2Q9Z0Z3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Skp2Q9Z0Z3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Skp2Q9Z0Z3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Skp2Q9Z0Z3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Skp2Q9Z0Z3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Skp2Q9Z0Z3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Skp2Q9Z0Z3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Skp2Q9Z0Z3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Skp2Q9Z0Z3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Skp2Q9Z0Z3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Skp2Q9Z0Z3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Skp2Q9Z0Z3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Skp2Q9Z0Z3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Skp2Q9Z0Z3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Skp2Q9Z0Z3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Skp2Q9Z0Z3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Skp2Q9Z0Z3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Skp2Q9Z0Z3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Skp2Q9Z0Z3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Skp2Q9Z0Z3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Skp2Q9Z0Z3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Skp2Q9Z0Z3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Skp2Q9Z0Z3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Skp2Q9Z0Z3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Skp2Q9Z0Z3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Skp2Q9Z0Z3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Skp2Q9Z0Z3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Skp2Q9Z0Z3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Skp2Q9Z0Z3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Skp2Q9Z0Z3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Skp2Q9Z0Z3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Skp2Q9Z0Z3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Skp2Q9Z0Z3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Skp2Q9Z0Z3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Skp2Q9Z0Z3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Skp2Q9Z0Z3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Skp2Q9Z0Z3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Skp2Q9Z0Z3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Skp2Q9Z0Z3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Skp2Q9Z0Z3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Skp2Q9Z0Z3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Skp2Q9Z0Z3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Skp2Q9Z0Z3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Skp2Q9Z0Z3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Skp2Q9Z0Z3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Skp2Q9Z0Z3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Skp2Q9Z0Z3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Skp2Q9Z0Z3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Skp2Q9Z0Z3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Skp2Q9Z0Z3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Skp2Q9Z0Z3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Skp2Q9Z0Z3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Skp2Q9Z0Z3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Skp2Q9Z0Z3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Skp2Q9Z0Z3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Skp2Q9Z0Z3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Skp2Q9Z0Z3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms